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Wiki général - informations techniques

• Suivre les instructions. C'est un peu lourd, mais on n'a qu'à le faire une fois, et ensuite on oublie. SVP si vous vous inscrivez, n'hésitez pas à compléter cette section.
• En s'inscrivant sur Calcul Canada, on a accès aux grappes de Calcul Québec:
  • Cedar, Graham et Béluga d'usage général
  • Niagara, pour les tâches parallèles intensives
  • Hélios, avec GPU

• Il y a régulièrement des séances d'information pour les débutants. Liste des formations Calcul Québec L'inscription se fait via la plateforme eventbrite.
• Pour se loguer (en supposant que votre nom d'usager soit “votrenom”): ssh votrenom@beluga.calculquebec.ca

Vidéo: Pipelines et gestion des données (1h) indique notamment dans quels répertoires mettre quels fichiers afin que les tests roulent plus vite. Notamment:

• scratch a un espace limité, doit être purgé à chaque mois. Un courriel est envoyé lorsqu'une purge est en vue. Utiliser seulement pour les fichiers temporaires.
• projet: données permanentes. Ne doit pas contenir de fichiers temporaires; pas de milliers de fichiers.
• nearline: pour stocker des données. Ne pas mettre de données actives. Ne pas mettre plein de petits fichiers; zipper au besoin. Peut être considéré comme un “entrepôt” pour quelques mois, par exemple lorsqu'un étudiant s'en va.
• home: pour les sources; aussi les sauvegarder dans git.
• SLURM_TMPDIR (variable d'environnement) peut être utilisé pour des lectures répétitives, moins long que sur scratch.

Par exemple, pour rouler un problème qui a beaucoup de petits fichiers, l'idéal est d'avoir tous les fichiers zippés, les dézipper dans SLURM_TMPDIR, rouler le problème, tout rezipper et les mettre dans scratch. Attention: Si on les laisse dans SLURM_TMPDIR, ils seront perdus!